ancient DNA

El ADN antiguo (aDNA) es ADN aislado de especímenes antiguos. Debido a los procesos de degradación (incluidos los enlaces cruzados, la desaminación y la fragmentación), el ADN antiguo está más degradado en comparación con el material genético contemporáneo. Incluso en las mejores condiciones de preservación, existe un límite superior de 0,4 a 1,5 millones de años para que una muestra contenga suficiente ADN para las tecnologías de secuenciación. La muestra más antigua jamás secuenciada se estima en 1,65 millones de años. El material genético se ha recuperado de material esquelético paleoarqueológico e histórico, tejidos momificados, colecciones de archivo de especímenes médicos no congelados, restos de plantas preservados, hielo y núcleos de permafrost, sedimentos marinos y lacustres y tierra de excavación. El 7 de diciembre de 2022, The New York Times informó que se encontró material genético de dos millones de años en Groenlandia, y actualmente se considera el ADN más antiguo descubierto hasta ahora. Historia de los estudios de ADN antiguo Década de 1980 El primer estudio de lo que se denominaría aDNA se realizó en 1984, cuando Russ Higuchi y sus colegas de la University of California, Berkeley informaron que rastros de ADN de un espécimen de museo de la quagga no solo permanecían en el espécimen más de 150 años después de la muerte del individuo, sino que podían extraerse y secuenciarse. Durante los dos años siguientes, mediante investigaciones sobre especímenes momificados naturales y artificiales, Svante Pääbo confirmó que este fenómeno no se limitaba a especímenes de museo relativamente recientes, sino que aparentemente podía replicarse en una variedad de muestras humanas momificadas que databan de varios miles de años atrás. Los laboriosos procesos que se requerían en ese momento para secuenciar dicho ADN (mediante clonación bacteriana) fueron un freno efectivo al estudio del ADN antiguo (aDNA) y al campo de la museómica. Sin embargo, con el desarrollo de la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) a finales de la década de 1980, el campo comenzó a progresar rápidamente. La amplificación por PCR de doble cebador de aDNA (PCR de salto) puede producir artefactos de secuencia altamente sesgados y no auténticos. Se utilizó una estrategia de PCR anidada con cebadores múltiples para superar esas limitaciones.