BOSS

Biochemical and Organic Simulation System (BOSS) es un programa de modelado molecular de propósito general que realiza cálculos de mecánica molecular, simulaciones de mecánica estadística de Monte Carlo de Metropolis y cálculos de mecánica cuántica semiempírica del Modelo Austin 1 (AM1), PM3 y PDDG/PM3. Los cálculos de mecánica molecular incluyen minimizaciones de energía, análisis de modos normales y búsqueda conformacional con los campos de fuerza Optimized Potentials for Liquid Simulations (OPLS). BOSS es desarrollado por el Prof. William L. Jorgensen en la Universidad de Yale, y distribuido comercialmente por Cemcomco, LLC y Schrödinger, Inc. Características principales Inventor del campo de fuerza OPLS Optimización de geometría Química cuántica semiempírica Simulaciones MC para líquidos puros, soluciones, cúmulos o sistemas en fase gaseosa Las energías libres se calculan a partir de la teoría de perturbación estadística (teoría de perturbación de energía libre (FEP)) Modelos de agua TIP3P, TIP4P y TIP5P Ver también Referencias