DAVID

DAVID (the database for annotation, visualization and integrated discovery) es un recurso bioinformático gratuito en línea desarrollado por el Laboratory of Human Retrovirology and Immunoinformatics (LHRI). Todas las herramientas en los DAVID Bioinformatics Resources tienen como objetivo proporcionar la interpretación funcional de grandes listas de genes derivadas de estudios genómicos, p. ej. estudios de microarreglos y proteómica. DAVID se puede encontrar en https://david.ncifcrf.gov/ The DAVID Bioinformatics Resources consta de la DAVID Knowledgebase y cinco suites integradas de herramientas de anotación funcional basadas en la web: the DAVID Gene Functional Classification Tool, the DAVID Functional Annotation Tool, the DAVID Gene ID Conversion Tool, the DAVID Gene Name Viewer y the DAVID NIAID Pathogen Genome Browser. La DAVID Knowledgebase expandida ahora integra casi todos los recursos bioinformáticos públicos principales y conocidos centralizados por el DAVID Gene Concept, un método de enlace único para aglomerar decenas de millones de identificadores diversos de genes/proteínas y términos de anotación de una variedad de bases de datos bioinformáticas públicas. Para cualquier lista de genes cargada, los DAVID Resources ahora proporcionan no solo el análisis de enriquecimiento de términos de genes típico, sino también nuevas herramientas y funciones que permiten a los usuarios condensar grandes listas de genes en grupos funcionales de genes, convertir entre identificadores de genes/proteínas, visualizar relaciones de muchos genes a muchos términos, agrupar términos redundantes y heterogéneos en grupos, buscar genes o términos interesantes y relacionados, ver dinámicamente genes de sus listas en biovías y más. DAVID 2021 update se lanzó en diciembre de 2021. La base de conocimientos está programada para actualizarse trimestralmente. Functionality DAVID proporciona un conjunto completo de herramientas de anotación funcional para que los investigadores comprendan el significado biológico detrás de una gran lista de genes. Para cualquier lista de genes dada, las herramientas de DAVID pueden: Identify enriched biological themes, particularly GO terms Discover enriched functional-related gene groups Cluster redundant annotation terms Visualize genes on BioCarta & KEGG pathway maps Display related many-genes-to-many-terms on 2-D view. Search for other functionally related genes not in the list List interacting proteins Explore gene names in batch Link gene-disease associations Highlight protein functional domains and motifs Redirect to related literatures Convert gene identifiers from one type to another.