Joseph Pomeroy Root (April 23, 1826 – July 20, 1885) foi um médico, político e líder dos Kansas Free Staters americano.
Descendente de uma antiga família da Nova Inglaterra, Root foi o bisneto do General da Guerra Revolucionária Seth Pomeroy. Ele se formou no Berkshire Medical College em Pittsfield e praticou medicina em New Hartford, Connecticut por cinco anos. Em 1855 ele foi eleito para a Connecticut House of Representatives, como um Whig.
Após seu mandato, ele se juntou a um grupo armado de colonos abolicionistas que acabaram se estabelecendo em Waubansee, Kansas. Depois de Root ter sido brevemente prisioneiro de colonos pró-escravidão, ele se dedicou à causa do Free State, tornando-se finalmente o presidente do comitê executivo free-state. Após negociar uma troca de prisioneiros com o governador pró-escravidão Wilson Shannon, Root deixou Kansas para arrecadar fundos, armas e apoio entre abolicionistas do Leste.
Ao retornar a Kansas, Root foi eleito para o senado territorial sob a Topeka Constitution, e logo se tornou presidente do senado e membro do Territorial Council. Após a ratificação da Wyandotte Constitution em 1861, Root foi eleito como o primeiro Lieutenant Governor do novo estado.
